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1 楼 
 文章标题 : 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-07 10:02 

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在我的一个文本文件(log.txt)的格式如下:
代码:
NCI_100058_a      -4.8
NCI_100058_b      -5.0
NCI_100120      -4.7
NCI_10042      -4.6
NCI_100827      -4.9
NCI_10091      -4.2
NCI_100942      -3.9
NCI_101266      -3.8
NCI_101679      -4.5
NCI_10173_a      -4.3
NCI_10173_b      -4.4
NCI_101789      -6.8
NCI_101809      -4.3
...........

其中以NCI起始的为某一目录下存在的一个文件,我想用一段脚本将这些文件提取到一个名为selected的目录中,请问该如何实现?


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2 楼 
 文章标题 : Re: 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-07 12:57 

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代码:
#!/bin/bash

for file in $(cat log.txt|grep -o "NCI_[^ ]*")    #log.txt  注意路径
do
   path=
   path=$(find . -name $file)   #find修改一下,此处搜索当前路径
   if [ -n "$path" ]; then
      cp $path /home/../selected#selected的绝对路径补充完整
      echo "${file}路径为${path}"
   else
      echo  "${file}未找到!"
   fi
done

exit 0

不知道理解错意思没,注释的地方要改下,高效的方法期待高人给出!


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民族的脊梁,是踏实做事的人,非只知道骂街的泼妇。


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3 楼 
 文章标题 : Re: 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-07 15:38 

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非常感谢您。find文件的时候,能不能设定在某一目录下包括子目录呢?


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4 楼 
 文章标题 : Re: 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-07 16:07 

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find搜索默认是包含子目录的(不包含某一子目录用-prune等参数),如果没有设搜索深度(man一下吧,find参数太多,一般用的时候再查)的话,都是包含搜索子目录的
find 的第一参数一般是搜索目录, . 为当前目录,把 . 换成你要搜索的目录就可以了 ,建议你查下find的用法

find是非常强大的命令,可以完成windows下面很多不能完成的搜索任务,但同时也是一个很难用熟的一个命令,记得基本的参数就可以了 .


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5 楼 
 文章标题 : Re: 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-07 17:21 

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:em11 非常感谢


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6 楼 
 文章标题 : Re: 用脚本批量提取指定的文件
帖子发表于 : 2009-10-11 22:35 

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今天将该教本用于大规模工作,发现在搜索3万个文件的时候,find不能搜到制定文件。即使是我先ls,然后find其中一个文件,还是不能搜到,何故?


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