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[原创]Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

发表于 : 2008-06-14 18:21
caixin5120
Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

第一步 安装Ubuntu8.04 做好linux系统的准备。

第二步 从新立得软件包管理器中安装Gmout-iso 软件 (虚拟光驱挂载软件)。

第三步 从新立得软件包管理器中安装搜索yum,选择yumpython-sqlitecachec,这两个软件安装;接下来搜索libmotif3,安装。 ------(此处是做好sybyl所需库的准备,以防后面报错。)

第四步 打开终端, $ sudo chomd 777 /usr/tmp/ ----给用户添加 /usr/tmp/文件夹的读写执行权限,这样就可以让用户直接安装sybyl7.3,不必要使用root超级用户了。

第五步 挂载iso虚拟光驱,打开 应用程序-系统工具-Gmout-iso,挂载你的sybyl7.3的第一张光盘。(以后的在安装过程中也用样的挂载光盘)

第六步 开始安装sybyl ,打开终端 $ /media/cdrom/install.sh ----执行sybyl的安装文件。
这个路径是我挂载光盘的位置,请根据自己的挂载光盘的位置来填写。

第七步 为sybyl找到license的来源,crack里面,设置sybyl的安装路径等,这里是窗口对话模式,自己填上就可以了,如同windows的软件安装一样。

Ok! 安装开始,完成第一张光盘后会提示你挂载第二张,第三张,第四张光盘。

最后的是启动,目前还是只能每次启动输入3个命令。

进入 AdminTools10.8/bin/linux 文件

$ cd /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux ----我放 AdminTools10.8的位置在/home/caixin
$ ./lmgrd triposlm
$ ./sybyl

当然你也可以做个软连接(相当于windows下的快捷方式)来启动。
$ ln /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux /home/caixin


到这里在Ubuntu8.04下sybyl7.3的安装就完成了。这是个人心得和安装方法,在自己摸索中总结出来的,希望能让初学者少走弯路,尽快接触sybyl7.3

声明:本文参考aspirin001作者的《ubuntu7.04下安装sybyl7.3》, 在此十分感谢aspirin001把自己的安装过程共享。我只是在这个基础上简化了安装过程,并指出不用安装python2.1,只需要yumpython-sqlitecachec就可以了。

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发表于 : 2008-07-27 20:14
xufund
我是在64位系统下安装的。在安装了32位库文件后(sudo apt-get install ia32lib),安装很顺利。不过我在启动时遇到了问题,找不到libtiff.so.3文件(大概是这个名)。我的/usr/下面有两个文件夹分别是lib和lib32,两个里面都有上面那个文件,我不知道与哪个进行软连接。希望高手指点。另外如果软连接错误如何取消?谢谢!

发表于 : 2008-07-27 21:53
caixin5120
第三步 从新立得软件包管理器中安装搜索yum,选择yum和python-sqlitecachec,这两个软件安装;接下来搜索libmotif3,安装。 ------(此处是做好sybyl所需库的准备,以防后面报错。)

发表于 : 2008-07-27 21:55
caixin5120
lin 软链接命令 就相当于 winows的 创建快捷方式。 不用怎么取消的 呵呵 删除就好了

发表于 : 2008-07-31 17:24
truemantwo
我在Ubuntu8.04下按楼主的方法安装Sybyl8.0,却怎么都不成功。
貌似还是Python2.1的问题。

发表于 : 2008-08-01 23:10
xufund
xufund 写了:我是在64位系统下安装的。在安装了32位库文件后(sudo apt-get install ia32lib),安装很顺利。不过我在启动时遇到了问题,找不到libtiff.so.3文件(大概是这个名)。我的/usr/下面有两个文件夹分别是lib和lib32,两个里面都有上面那个文件,我不知道与哪个进行软连接。希望高手指点。另外如果软连接错误如何取消?谢谢!
我分别把lib,lib32和lib64里的libtiff.so.4用软连接指向libtiff.so.3(因为只有libtiff.so.4),但在运行是还是提示找不到libtiff.so.3文件。不知为何,期待高手解决。谢谢!

发表于 : 2008-08-26 15:01
xufund
请教楼主。我按照您介绍的方法在32和64位都安装了。虽然画结构式和能量优化没问题,但按说明书做FLEXX时,在Input 选项中Config file 采用默认的//tables/default.dat,点击 Transform Details时出现错误提示“You must specify a valid existing config file to proceed“。检查了tables目录,里面确实是空的。
不知你在做FLEXX时是否出现相同的情况?能帮助找一下是哪里出了问题?如何解决?谢谢!

Re: [原创]Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

发表于 : 2009-08-15 17:59
neuroglobin
64位系统在/usr/lib32/下做 sudo ln -s libtiff.so.4.2.1 libtiff.so.3

Re: [原创]Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

发表于 : 2010-04-06 10:38
AIliutao
您好,我按照您的方法安装。我的平台是Ubuntu9.04,我的sybyl7.3的安装路径是/home/y301/soft/sybyl7.3。最后在启动的时候出现了一下问题,
01-desktop": Not a valid server hostname, exiting.
9:33:51 (lmgrd) Valid license server system hosts are: "y301"
9:33:51 (lmgrd) Using license file "/usr/local/flexlm/licenses/license.dat"
我已经把"/usr/local/flexlm/licenses/license.dat中license的名字改为了y301,也把它复制到了AminTools10.8的table中了,怎么还提示以上的问题呢
。这怎么解决呢。谢谢