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1 楼 
 文章标题 : Chemistry Software Problem on Ubuntu 6.06 LTS
帖子发表于 : 2006-07-05 5:59 

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Hi, I got intalling problem for chemistry software: VMD (visual molecular dynamics) and J2SE 2.4.4.12 SDK (Java 2 standard edition 2.4* software developer kit).
Also, I got problem with installing latest version mplayer.

I notice that there are some problems with the gcc complier. I tried to apt-get, but failed. The instal instruction from VMD do help to install VMD in FC5 but not the ubuntu. Anybody can help me out? Thank you very much!

Sorry, I have not got scim input chinese under english enviroment. So, I cannot write chinese at this moment.


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2 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-05 9:22 
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VMD 1.84?

安装问题具体是什么?
我记得需要先
sudo apt-get install build-essential csh

除此之外安装没有任何问题,直接make,make install就行了。

然后就是显卡驱动要装好才能正常显示


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3 楼 
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帖子发表于 : 2006-07-05 16:17 

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多谢楼上Tenyears的回复.
是的,是VMD 1.8.4? 我执行了
sudo apt-get install build-essential csh
但是返回的信息是
Reading package lists ... Done
Building dependency tree... Done
E: Couldn't find package csh

我安装后系统后没有改源,记得5.10的时候好像要改的..但是这个我还没有改.请问我是否还要改到那个比较好一点的源才好.
When I do ./configure, I get an error:
using configure.options: LINUX OPENGL FLTK TK ACTC IMD SACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT.
在configure.options里也是同样的话.
我的显卡是ATI 7500.应该是通用显卡了.在SUSE中就能正确安装的.这个版本里也正确显示出了Radeon Mobility M7 LW [Radeon Mobility 7500]

谢谢帮忙!


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4 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-05 18:00 
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Beibao 写道:
using configure.options: LINUX OPENGL FLTK TK ACTC IMD SACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT.

这不是错误信息。是正常输出,告诉你这是你所选的(默认)编译选项。
我估计安装已经没有问题了。

csh是必需的,不过不影响安装,只影响使用。


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5 楼 
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帖子发表于 : 2006-07-05 19:11 

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谢谢Tenyears.但是我还是不能安装上csh,请问怎样才能安上.安装的时候说找不到csh.
谢谢你热心解答!


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6 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-05 20:12 
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你换cn99的源试试,我查了一下,有。


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7 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-05 20:15 
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sudo apt-cache search csh

bash - The GNU Bourne Again SHell
bash-doc - Documentation and examples for the The GNU Bourne Again SHell
libgd-gd2-noxpm-perl - Perl module wrapper for libgd - gd2 variant without XPM support
libgd-gd2-perl - Perl module wrapper for libgd - gd2 variant
openssh-client - Secure shell client, an rlogin/rsh/rcp replacement
openssh-server - Secure shell server, an rshd replacement
tcsh - TENEX C Shell, an enhanced version of Berkeley csh
bash-minimal - The GNU Bourne Again SHell (minimal version)
bash-static - The GNU Bourne Again SHell (static version)
binfmtc - Execute C program as script

csh - Shell with C-like syntax, standard login shell on BSD systems
electricsheep - screensaver showing collective dream of sleeping computers
kiss - Karel's Interactive Simple Shell
ledit - line editor for interactive programs
scsh - A `scheme' interpreter designed for writing system programs (default version)
scsh-0.6 - A `scheme' interpreter designed for writing system programs
scsh-0.6-doc - Documentation for scsh, "The Scheme Shell"
scsh-common-0.6 - A `scheme' interpreter designed for writing system programs
scsh-doc - Documentation for scsh, "The Scheme Shell"
ssh-krb5 - Secure rlogin/rsh/rcp replacement (OpenSSH with Kerberos)
tcsh-kanji - TENEX C Shell, an enhanced version of Berkeley csh
zec - Z-Shell Empire client
sdic-eijiro - Installer for EIJIRO dictionaries for sdic


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8 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-06 2:33 

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excuted: sudo apt-cache search csh
Got back:

bash - The GNU Bourne Again SHell
bash-doc - Documentation and examples for the The GNU Bourne Again SHell
libgd-gd2-noxpm-perl - Perl module wrapper for libgd - gd2 variant without XPM support
libgd-gd2-perl - Perl module wrapper for libgd - gd2 variant
openssh-client - Secure shell client, an rlogin/rsh/rcp replacement
openssh-server - Secure shell server, an rshd replacement
tcsh - TENEX C Shell, an enhanced version of Berkeley csh


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9 楼 
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帖子发表于 : 2006-07-06 4:43 

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I got it once I change the new resource. Thanks!


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10 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-06 5:09 

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Many many great thanks to Tenyears for your kindest helps! Very helpful!
The most important thing is get the resource (cn99), which illustrates at wiki.
Then,
1. sudo apt-get install build-essential csh
2. ./configure
If you do well install your driver for your graphic card, just enjoy the VMD.

Many thanks to Tenyears again.


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11 楼 
 文章标题 :
帖子发表于 : 2006-07-06 8:55 
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不客气。

接下来还有
make
make install
大概是吧


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