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google到：
在菜单->工具->首选项->高级->程序->选择其他协议的帮手程序中，添加一项，协议为 ed2k，程序为 /usr/bin/ed2k.amule
但加协议后点击ed2k只是提示：
Open file
/usr/bin/ed2k.amule
with
gnome-open

但aMule中没有打开。

程序应该为一个bash。就是要把传入的参数行用""包括起来。
#!/bin/bash

/usr/bin/ed2k "%1"

类似这样的。试试。我没测试的。但确定是参数没包括的事情。而且amule必须是运行中。