About python

[yimaizhe]

Hi,Everyone,
I am using ubuntu 10.10 and the python installed by "command:sudo apt-get install python" is python2.6.6
And I am intended to run a software compile by python2.6.6 from 2 egg files.

what is the matter when occurring this type of error ?
Thanks.


p8h61@p8h61-System-Product-Name:~/pipeline$ ./birdsuite_converter --familyfile /home/p8h61/TEST/Output.fam --plateroot /home/p8h61/TEST/plates --metadir /home/p8h61/TEST/installed_metadata --outputdir ~/output --celmap /home/p8h61/TEST/Output.celMap --ignorefam
=========================================================
= BIRDSUITE FORMAT CONVERTER =
=========================================================

FAWKES->GVAR:
Looking SNP map: genomewidesnp_6.rs_snp_map
Traceback (most recent call last):
File "./birdsuite_converter", line 9, in <module>
load_entry_point('plinkpipeline==1.6.6', 'console_scripts', 'birdsuite_converter')()
File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/plinkpipeline-1.6.6-py2.5.egg/plink_pipeline/birdsuite_to_plink.py", line 125, in main
fawkes_to_gvar.main(current_args)
File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/plinkpipeline-1.6.6-py2.5.egg/plink_pipeline/fawkes_to_gvar.py", line 83, in main
if len(map_files > 0):
TypeError: object of type 'bool' has no len()

[vicwjb]

很明显了，告诉你bool类型没有len()函数可用啊。。
也就是说你map_files 可能在哪个部分被强制转换成bool类型了。。。
所以：if len(map_files > 0): 这句出错了！！
检查一下map_files 这个变量的前世今生把。。。。。

[anticlockwise]

。。。map_files > 0 这个为bool变量，len(map_files > 0)当然就行不通啊……

这是写错了吧……应该是：

len(map_files) > 0吧……

其实这样效率还不太好，如果想判断map_files是否为空的话，直接：
if map_files:
....


就可以了～～

[yimaizhe]

。。。map_files > 0 这个为bool变量，len(map_files > 0)当然就行不通啊……

这是写错了吧……应该是：

len(map_files) > 0吧……

其实这样效率还不太好，如果想判断map_files是否为空的话，直接：
if map_files:
....


就可以了～～

您好，我完全不懂这些什么变量之类的东西，这个是在运行一个叫Pipeline的文件转换软件的时候出现的错误，我想知道的是针对这种错误我该怎么办就能解决这个问题，让这个程序能正常运行？如果需要什么其他文件来帮助您诊断，我可以提供，非常感谢，我不知道该怎么办好久了！

[anticlockwise]

。。。map_files > 0 这个为bool变量，len(map_files > 0)当然就行不通啊……

这是写错了吧……应该是：

len(map_files) > 0吧……

其实这样效率还不太好，如果想判断map_files是否为空的话，直接：
if map_files:
....


就可以了～～

您好，我完全不懂这些什么变量之类的东西，这个是在运行一个叫Pipeline的文件转换软件的时候出现的错误，我想知道的是针对这种错误我该怎么办就能解决这个问题，让这个程序能正常运行？如果需要什么其他文件来帮助您诊断，我可以提供，非常感谢，我不知道该怎么办好久了！

这是程序本身有的BUG，如果这个东西不是你写的，请联系写这个的作者～～如果是你写的，这句错误很明显：

File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/plinkpipeline-1.6.6-py2.5.egg/plink_pipeline/fawkes_to_gvar.py", line 83, in main

把fawkes_to_gvar.py文件第83行的if len(map_files > 0): 改成 if map_files:

这只是试试，如果程序有其他的BUG，那就没办法了～～

[yimaizhe]

。。。map_files > 0 这个为bool变量，len(map_files > 0)当然就行不通啊……

这是写错了吧……应该是：

len(map_files) > 0吧……

其实这样效率还不太好，如果想判断map_files是否为空的话，直接：
if map_files:
....


就可以了～～

Thanks a lot.
It works very well.


您好，我完全不懂这些什么变量之类的东西，这个是在运行一个叫Pipeline的文件转换软件的时候出现的错误，我想知道的是针对这种错误我该怎么办就能解决这个问题，让这个程序能正常运行？如果需要什么其他文件来帮助您诊断，我可以提供，非常感谢，我不知道该怎么办好久了！

这是程序本身有的BUG，如果这个东西不是你写的，请联系写这个的作者～～如果是你写的，这句错误很明显：

File "/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/plinkpipeline-1.6.6-py2.5.egg/plink_pipeline/fawkes_to_gvar.py", line 83, in main

把fawkes_to_gvar.py文件第83行的if len(map_files > 0): 改成 if map_files:

这只是试试，如果程序有其他的BUG，那就没办法了～～