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1 楼 
 文章标题 : 安装peridigm遇到问题
帖子发表于 : 2016-03-14 16:26 

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小弟初学者,win7系统,然后用硬盘装的ubuntu15.10系统。

现在在ubuntu上装peridigm软件。前面先预装了mpich-3.2,boost-1-60,hdf5-1.8.16,netcdf4.3.3.1,zlib1.2.8,trilinos。最后装的peridigm。前面的程序包都是在网上找到方法用prefix的路径安装的。最后的peridigm基本安装官网方法安装的。https://peridigm.sandia.gov/content/building-peridigm

目前基本算装上了,但是不能用。
代码:
su@su-B85M-HD3:~/Peridigm/examples/disk_impact$ /opt/peridigm/bin/Peridigm disk_impact.peridigm
[su-B85M-HD3:23240] *** Process received signal ***
[su-B85M-HD3:23240] Signal: Segmentation fault (11)
[su-B85M-HD3:23240] Signal code: Address not mapped (1)
[su-B85M-HD3:23240] Failing at address: 0x44000098
[su-B85M-HD3:23240] [ 0] /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0x10d10) [0x7f78424bad10]
[su-B85M-HD3:23240] [ 1] /usr/lib/libmpi.so.1(PMPI_Comm_rank+0x43) [0x7f7841471af3]
[su-B85M-HD3:23240] [ 2] /opt/peridigm/bin/Peridigm(main+0x5b) [0x67033b]
[su-B85M-HD3:23240] [ 3] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0xf0) [0x7f78407bea40]
[su-B85M-HD3:23240] [ 4] /opt/peridigm/bin/Peridigm(_start+0x29) [0x680029]
[su-B85M-HD3:23240] *** End of error message ***
段错误 (核心已转储)

以上是做算例试运行的结果,提示有错误。看起来可能是有些库的调用问题,但是小弟读不懂,希望大神能来帮忙解释一下! :Effort

下面再贴一段.bashrc文件里的环境变量设置,可能有些地方设置不对。
代码:
export CC=mpicc
export CXX=mpicxx
export FC=mpif90
export F77=mpif77
export Boost_INCLUDE_DIRS=/usr/local/boost/include/boost:$PATH
export Boost_LIBRARY_DIRS=/usr/local/boost/lib:$PATH
export PATH=/usr/local/hdf5:$PATH
export CPPFLAGS=-l/usr/local
export LDFLAGS=-L/usr/local
export PATH=/usr/sbin:/usr/bin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/bin:/sbin:$PATH
export PATH=/usr/local/netcdf/bin:$PATH

export DYLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf/lib:$DYLD_LIBRARY_PATH

#peridigm

export PATH=/opt/peridigm/bin:/usr/local/trilinos/bin:/opt/mpich-3.2/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/boost/lib:/usr/local/netcdf/lib:/opt/mpich-3.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH


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2 楼 
 文章标题 : Re: 安装peridigm遇到问题
帖子发表于 : 2016-03-14 17:47 

注册: 2009-08-04 16:33
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1. Ubuntu 套件庫 並沒有 peridigm 套件
http://packages.ubuntu.com/search?suite ... chon=names
引用:
段错误 (核心已转储)

2. 通常指 內存 RAM 配置有問題
2-1. https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%A8%98 ... F%E8%AA%A4
記憶體區段錯誤
2-2. http://askubuntu.com/questions/138407/w ... tion-fault
What is a segmentation fault?


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3 楼 
 文章标题 : Re: 安装peridigm遇到问题
帖子发表于 : 2016-03-14 19:18 

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[quote="poloshiao"]1. Ubuntu 套件庫 並沒有 peridigm 套件
http://packages.ubuntu.com/search?suite ... chon=names

peridigm是个比较新的代码包,而且用的人比较少,应该是没有放到库里。求大神指点蠢新怎么看维基百科。。打不开。。 :Cry


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4 楼 
 文章标题 : Re: 安装peridigm遇到问题
帖子发表于 : 2016-03-14 19:43 
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suboyang 写道:
求大神指点蠢新怎么看维基百科。。打不开。。

目前 中文唯鸡的峰索强度不大,用自定义 hosts 可破。具体我没有试过。

示例项目 https://github.com/search?utf8=%E2%9C%9 ... rchresults


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5 楼 
 文章标题 : Re: 安装peridigm遇到问题
帖子发表于 : 2016-03-16 9:17 

注册: 2016-03-14 16:17
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系统: ubuntu15.10
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poloshiao 写道:
1. Ubuntu 套件庫 並沒有 peridigm 套件
http://packages.ubuntu.com/search?suite ... chon=names
引用:
段错误 (核心已转储)

2. 通常指 內存 RAM 配置有問題
2-1. https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%A8%98 ... F%E8%AA%A4
記憶體區段錯誤
2-2. http://askubuntu.com/questions/138407/w ... tion-fault
What is a segmentation fault?

维基百科打不开怎么破啊大神


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