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在下面的网址http://mgltools.scripps.edu/News/mgltools-available-for-debian看到autodock软件也有了deb包。但是按照该网站的提示，执行以下命令：

sudo aptitude install autodocktools autogrid autodock

系统只能安装autogrid和autodock，却找不到autodocktools.

请教如何解决？

use synaptic package manager then search autodock

去autodock的官网下载autodock tools去吧，然后安就行了。
不要什么都用apt-get来安装。

apt-get让Linux 变的越来越 简单了，不知道是好还是坏？！