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求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 9:49
yimaizhe
我要安装一个软件,到最后一步了,但是呢需要改一句话。

Edit birdsuite.sh, and add the following arguments to the java command line: --exeDir=EXEDIR --metadataDir=METADATADIR

Whereas I do not know where is the java command line and where to add the commands.
Could you please help me to add the command ?
Attached is the Birdsuite.sh. I have changed the file into a txt format, ' cause the .sh format is prohibited to upload.
Thanks in advance.

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 10:02
levee
应该是改动脚本的最后一句。

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 10:08
yimaizhe
levee 写了:应该是改动脚本的最后一句。
非常感谢您的回复
具体是如何改呢?是该加在哪个地方呢?能不能说得详细一点?

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 10:18
levee
鉴于提示说的是‘add the following arguments“,那么就应该是把”--exeDir=EXEDIR --metadataDir=METADATADIR“这一句添加到后面,改过之后的最后一行就是

代码: 全选

java -jar $exedir/Birdsuite.jar $exedir_args $* --exeDir=EXEDIR --metadataDir=METADATADIR

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 10:24
yimaizhe
levee 写了:鉴于提示说的是‘add the following arguments“,那么就应该是把”--exeDir=EXEDIR --metadataDir=METADATADIR“这一句添加到后面,改过之后的最后一行就是

代码: 全选

java -jar $exedir/Birdsuite.jar $exedir_args $* --exeDir=EXEDIR --metadataDir=METADATADIR

按照您的改动过了,我输入测试命令,但是为什么是这么提示呢?

bhli@ubuntu:~/TESTDIR$ EXEDIR/birdsuite.sh --basename=test --chipType=GenomeWideSNP_6 --outputDir=output --genderFile=test.gender --celFiles=test.cels --noLsf --apt_probeset_summarize.force
bash: EXEDIR/birdsuite.sh: 没有那个文件或目录

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 10:45
levee
错误是没找到birdsuite.sh文件,一般来说这意味着birdsuite.sh文件没有放到正确的位置。

Re: 求助:关于修改语言

发表于 : 2011-05-19 11:16
yimaizhe
levee 写了:错误是没找到birdsuite.sh文件,一般来说这意味着birdsuite.sh文件没有放到正确的位置。

但是这个文件还在原来的地方呀,我都没有动过,相反,我不进入那个文件反倒出现这样的情况:
bhli@ubuntu:~$ EXEDIR/birdsuite.sh --basename=test --chipType=GenomeWideSNP_6 --outputDir=output --genderFile=test.gender --celFiles=test.cels --noLsf --apt_probeset_summarize.force
+ unset DISPLAY
+ export MCR_INHIBIT_CTF_LOCK=1
+ MCR_INHIBIT_CTF_LOCK=1
++ EXEDIR/getAbsPath EXEDIR
EXEDIR/birdsuite.sh: line 40: EXEDIR/getAbsPath: 没有那个文件或目录
+ exedir=